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明治34年2月1日、六郷橋～官設大森間開通と同時に開業。
道路上の停留所であったが大正12年4月1日、新設軌道上に位置を変更した。
駅名の由来は、当時の地名から名付けたもので、この地名も明治の末頃六郷村に編入され、現在は駅名にその名を残すのみとなっている。
戦後、同駅のホーム延伸および将来の高架工事のために隣接の土地を取得し、昭和49年11月には、同土地に付随した用地に、当社初の分譲マンション（メガロン仲六郷）が完成した。
また、昭和53年2月から運転保安度向上屋輸送力増強のため、同駅の改良工事を進めていたが、昭和54年7月に完成した。
この工事により構内踏切道から地下通路になり、ホームも6両用に延伸された。